Cụ thể, giao Cục Quản lý đầu tư xây dựng (cơ quan chuyên môn trực thuộc Bộ) cơ quan chuyên môn về xây dựng đối với các dự án đường bộ cao tốc Bắc - Nam phía Đông được đầu tư theo phương thức đầu tư công (bao gồm các dự án do Tổng công ty Đầu tư phát triển đường cao tốc Việt Nam làm chủ đầu tư: Đà Nẵng - Quảng Ngãi, Bến Lức - Long Thành); các dự án đường bộ cao tốc trong Chương trình phục hồi kinh tế và các dự án đường bộ cao tốc trong giai đoạn phân kỳ (Chợ Mới - Bắc Kạn và Chơn Thành - Đức Hòa) cho đến khi dự án đầu tư được phê duyệt.

Đối với các dự án đường bộ cao tốc khác (trừ các dự án nêu trên) được giao Cục Đường cao tốc Việt Nam. Đối với các dự án đường bộ cao tốc trong Chương trình phục hồi kinh tế và các dự án đường bộ cao tốc trong giai đoạn phân kỳ (Chợ Mới - Bắc Kạn và Chơn Thành - Đức Hòa), Cục Đường cao tốc Việt Nam sẽ tiếp nhận hồ sơ dự án để thực hiện nhiệm vụ cơ quan chuyên môn về xây dựng, cơ quan chuyên môn trực thuộc Bộ sau khi dự án đầu tư được phê duyệt. Bên cạnh đó, Cục Đường cao tốc Việt Nam cũng được giao thực hiện một số nhiệm vụ của cơ quan có thẩm quyền, cơ quan ký kết hợp đồng đối với các dự án đường bộ cao tốc đầu tư theo phương thức đối tác công tư do Bộ Giao thông vận tải là cơ quan có thẩm quyền theo quy định (bao gồm các dự án đường cao tốc Bắc - Nam phía Đông).

Cục Quản lý đầu tư xây dựng và Cục Đường cao tốc Việt Nam sẽ chịu trách nhiệm tổ chức giao nhận đầy đủ hồ sơ, tài liệu liên quan của các dự án để tiếp tục thực hiện chức năng, nhiệm vụ theo quy định. Riêng Cục Đường cao tốc Việt Nam chịu trách nhiệm đảm bảo đầy đủ các điều kiện triển khai thực hiện, không ảnh hưởng đến chất lượng, tiến độ các dự án; kịp thời báo cáo Lãnh đạo Bộ những khó khăn, vướng mắc để được kịp thời xem xét, xử lý./.